Funkcjonowanie Ośrodka opiera się na zasadzie jednoosobowego kierownictwa, służbowego podporządkowania, podziału czynności i indywidualnej odpowiedzialności za wykonywanie powierzonych zadań.
Pracą Ośrodka kieruje Dyrektor i ponosi odpowiedzialność za jego wyniki. Dyrektor kieruje pracą Ośrodka przy pomocy głównego księgowego oraz kierowników działów.
Dyrektor dokonuje przydzału zadań, kompetencji i odpowiedzialności głównemu księgowemu oraz kierownikom działów i przy ich pomocy nadzoruje realizację zadań na poszczególnych stanowiskach pracy.